De Filipijnse wet vereist van georganiseerde religies dat deze zich registeren bij de Beurscommissie en bij de Belastingdienst om belastingvrijstellingsstatus vast te stellen. Op 16 december 2003 werd de Missie van de Scientology Kerk van de Filipijnen geregistreerd onder de categorie 9191 Activiteiten van Religieuze Organisaties door de Republiek der Filipijnen.
“Dit certificaat erkent de organisatie als rechtspersoon, en heeft bepaald dat het betrokken is bij activiteiten behorende bij een religieuze organisatie.”